Для настройки прокси, идем в групповые политики - User Configuration -> Preferences -> Control Panel Settings -> Internet Settings
(Совет. Политика Internet Explorer 10 действует и на Internet Explorer 11 (в xml файлах политики можно увидеть, что опция действительна для всех версии IE, начиная c 10.0.0.0 и заканчивая 99.0.0.0).
или ветка реестра — HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Internet Settings
"MigrateProxy"=dword:00000001
"ProxyEnable"=dword:00000001
"ProxyHttp1.1"=dword:00000000
"ProxyServer"="http://ProxyServername:80"
"ProxyOverride"="<local>"